Splicing y susceptibilidad genética a cáncer
Centro de investigación: Instituto de Biomedicina y Genética Molecular de Valladolid (IBGM), Valladolid · Valladolid
Investigador Principal: Eladio A. Velasco Sampedro · ea.velasco@csic.es
Área RER: Tecnologías aplicadas
Una alta proporción de variantes de ADN en genes responsables de enfermedades causa alteraciones de splicing. Nuestra línea principal de investigación se centra los genes de susceptibilidad a cáncer de mama/ovario hereditario (BC/OC) y el estudio de anomalías de splicing inducidas por variantes. Dichas variantes pueden afectar a secuencias esenciales de splicing (básicamente, sitios donador/aceptor) o elementos reguladores como enhancers/silenciadores, generando transcritos aberrantes asociados a una enfermedad. Nuestro grupo tiene un especial interés en la (des)regulación de exones alternativos y exones especiales ya sea por su tamaño (macro y microexones) o por la presencia de sitios de splicing atípicos que difieren de la regla GT-AG.
Los minigenes híbridos en el vector de splicing pMAD®(Mis-splicing And Disease) son nuestra herramienta principal. Hemos construido una batería de minigenes de los principales genes BC/OC (BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2, RAD51C, RAD51D, BARD1) y TP53, en los que se puede testar el impacto en el splicing de cualquier variante candidata mediante un protocolo sencillo. Hasta el momento ya hemos analizado ~1.000 variantes de dichos genes.
Asimismo, a través de un servicio externo de minigenes hemos participado en estudios de splicing de genes responsables de otras enfermedades hereditarias raras: COL1A1, CHD7, SERPINA1, UGT1A1, GRN.

Proyectos de Investigación del grupo relacionados
Publicaciones del grupo
Systematic Minigene-Based Splicing Analysis and Tentative Clinical Classification of 52 CHEK2 Splice-Site Variants
DOI: 10.1093/clinchem/hvad125. PMID: 37725924
Minigene-based splicing analysis and ACMG/AMP-based tentative classification of 56 ATM variants
DOI: 10.1002/path.5979. PMID: 35716007
Splicing predictions, minigene analyses, and ACMG-AMP clinical classification of 42 germline PALB2 splice-site variants
DOI: 10.1002/path.5839
RAD51D Aberrant Splicing in Breast Cancer: Identification of Splicing Regulatory Elements and Minigene-Based Evaluation of 53 DNA Variants
DOI: 10.3390/cancers13112845
UGT1A1 Variants c.864+5G>T and c.996+2_996+5del of a Crigler-Najjar Patient Induce Aberrant Splicing in Minigene Assays
DOI: 10.3389/fgene.2020.00169
Listado de técnicas en la que el grupo es experto
Ensayos funcionales de splicing mediante minigenes
Nombre enfermedad | ORPHA | |
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Cáncer de mama familiar | 227535 | Cáncer de mama familiar |