Grupo de Modelado Molecular

Laboratorio de biología computacional. El trabajo se centra en la integración de información evolutiva y estructural para estudiar la función de las proteínas, la simulación de procesos dinámicos de interacción proteína-proteína y proteína-ligando, el desarrollo de nuevos sistemas de diseño de fármacos “in silico” y la generación de nuevos métodos cuantitativos para biología computacional.

Proyectos actuales:
.- Análisis mediante simulación computacional de reacciones enzimáticas catalizadas por enzimas de interés biomédico. Diseño de inhibidores específicos. Cohesina: Análisis de las interacciones moleculares entre los componentes proteicos del anillo de cohesina y de la interacción del complejo proteico con el ADN.
.- Desarrollo de un nuevo y eficaz sistema de diseño de fármacos basado en la simulación dinámica computacional de estructuras macromoleculares. Basado en el análisis de centros activos de enzimas, el método desarrollado por nuestro grupo consiste en simular estas estructuras proteicas mediante dinámica molecular durante varios cientos de nanosegundos, seleccionar diferentes estructuras representativas y filtrar una base de datos de compuestos 3D para cada una de ellas.
.- Análisis mediante simulación computacional de reacciones enzimáticas catalizadas por enzimas de interés biomédico. Diseño de inhibidores específicos. Cohesina: Análisis de las interacciones moleculares entre los componentes proteicos del anillo de cohesina y de la interacción del complejo proteico con el ADN.
.- Desarrollo de un nuevo y eficaz sistema de diseño de fármacos basado en la simulación dinámica computacional de estructuras macromoleculares. Basado en el análisis de centros activos de enzimas, el método desarrollado por nuestro grupo consiste en simular estas estructuras proteicas mediante dinámica molecular durante varios cientos de nanosegundos, seleccionar diferentes estructuras representativas y filtrar una base de datos de compuestos 3D para cada una de ellas.